अपना संस्थान जल संचयन को अपनी प्राथमिकताओं में प्रमुख स्थान देता है। संस्थान का उद्देश्य जल के प्राकृतिक स्रोतों को संरक्षित करना और पानी की कमी की समस्या का समाधान ढूंढ़ना है। इसके तहत वर्षा जल संचयन की तकनीकों को बढ़ावा दिया जाता है, जैसे परंपरागत जलाशयों का पुनर्निर्माण, तालाब गहरीकरण, और जलग्रहण क्षेत्रों का संरक्षण। अपना संस्थान ने ग्रामीण और शहरी क्षेत्रों में जल संचयन अभियानों के माध्यम से समुदायों को जल संरक्षण के महत्व के प्रति जागरूक किया है। साथ ही, संस्थान स्थानीय लोगों को प्रशिक्षण प्रदान करता है ताकि वे जल प्रबंधन की तकनीकों को आत्मसात कर सकें। इस पहल का उद्देश्य न केवल पानी की समस्या का हल निकालना है, बल्कि आने वाली पीढ़ियों के लिए जल संसाधनों को सुरक्षित करना भी है।